Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PARVAQ9NVD7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PARVAQ9NVD7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms