Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNF275Q9NSD4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms