Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MEPEQ9NQ76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms