Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LIN28AQ9H9Z2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms