Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms