Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMBRA1Q9C0C7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms