Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CIPCQ9C0C6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms