Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TRIM54Q9BYV2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms