Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TDRD1Q9BXT4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms