Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAF4Q9BUZ4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF4Q9BUZ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms