Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2AFJQ9BTM1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms