Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms