Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBBP8Q99708 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms