Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PITX2Q99697 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PITX2Q99697 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms