Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CITED4Q96RK1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms