Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNX18Q96RF0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms