Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q80

DERL3, Derlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DERL3Q96Q80 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
DERL3Q96Q80 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DERL3Q96Q80 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms