Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRRC1Q96M27 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms