Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms