Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGF29Q96ES7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SGF29Q96ES7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms