Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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