Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms