Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NCSTNQ92542 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCSTNQ92542 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NCSTNQ92542 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCSTNQ92542 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NCSTNQ92542 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms