Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC4Q8WW27 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms