Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SNX29Q8TEQ0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SNX29Q8TEQ0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms