Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms