Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms