Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHCHD4Q8N4Q1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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