Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms