Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CD163Q86VB7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CD163Q86VB7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms