Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATG4DQ86TL0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATG4DQ86TL0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms