Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYT9Q86SS6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms