Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PKD1L3Q7Z443 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms