Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRCQ7RTU9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
STRCQ7RTU9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms