Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
USP34Q70CQ2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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