Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC129Q6ZRS4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms