Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PDZRN4Q6ZMN7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms