Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CASC2Q6XLA1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms