Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms