Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC171Q6TFL3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC171Q6TFL3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms