Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATAD2Q6PL18 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATAD2Q6PL18 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms