Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LRRC8EQ6NSJ5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LRRC8EQ6NSJ5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms