Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ECM29Q5VYK3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ECM29Q5VYK3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms