Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HECTD3Q5T447 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms