Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LDLRAP1Q5SW96 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms