Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PIK3CD-AS1Q5SR53 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms