Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPANXN4Q5MJ08 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms