Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TDRD12Q587J7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms