Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCA8Q53HL2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCA8Q53HL2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms