Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL22Q53GT1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KLHL22Q53GT1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms